Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd3P55096 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcd3P55096 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms