Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rad23aP54726 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms