Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh6P54276 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh6P54276 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh6P54276 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh6P54276 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms