Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms