Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2e1P52482 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms