Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Defa-rs12P50716 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Defa-rs12P50716 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Defa-rs12P50716 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Defa-rs12P50716 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Defa-rs12P50716 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defa-rs12P50716 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defa-rs12P50716 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Defa-rs12P50716 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms