Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc3P49135 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc3P49135 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms