Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brcc3P46737 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms