Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig1P37913 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lig1P37913 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lig1P37913 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms