Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly6dP35459 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly6dP35459 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms