Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Grin2aP35436 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Grin2aP35436 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Grin2aP35436 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms