Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lef1P27782 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms