Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccnd1P25322 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnd1P25322 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms