Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd247P24161 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd247P24161 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd247P24161 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd247P24161 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd247P24161 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd247P24161 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd247P24161 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd247P24161 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd247P24161 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cd247P24161 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cd247P24161 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms