Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PparaP23204 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PparaP23204 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PparaP23204 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PparaP23204 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PparaP23204 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PparaP23204 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PparaP23204 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PparaP23204 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PparaP23204 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PparaP23204 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PparaP23204 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PparaP23204 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PparaP23204 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PparaP23204 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PparaP23204 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms