Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou3f1P21952 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pou3f1P21952 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms