Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP20293 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP20293 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP20293 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP20293 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP20293 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP20293 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TP20293 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TP20293 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TP20293 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP20293 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP20293 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP20293 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP20293 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP20293 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP20293 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP20293 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP20293 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP20293 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP20293 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP20293 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP20293 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP20293 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms