Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtpraP18052 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpraP18052 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpraP18052 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpraP18052 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtpraP18052 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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