Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsaP16675 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsaP16675 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtsaP16675 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtsaP16675 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtsaP16675 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsaP16675 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsaP16675 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsaP16675 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms