Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkceP16054 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkceP16054 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms