Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Dnmt1P13864 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dnmt1P13864 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dnmt1P13864 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms