Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cntn1P12960 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntn1P12960 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms