Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nr4a1P12813 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nr4a1P12813 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms