Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chrm1P12657 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chrm1P12657 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms