Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamp1P11438 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamp1P11438 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms