Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl2P10148 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms