Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms