Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P0C1Z5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms