Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Surf1P09925 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Surf1P09925 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Surf1P09925 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Surf1P09925 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Surf1P09925 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms