Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd3P09027 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd3P09027 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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