Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NefmP08553 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefmP08553 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefmP08553 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefmP08553 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefmP08553 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefmP08553 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefmP08553 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefmP08553 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NefmP08553 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NefmP08553 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NefmP08553 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NefmP08553 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NefmP08553 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NefmP08553 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefmP08553 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefmP08553 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefmP08553 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefmP08553 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefmP08553 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefmP08553 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefmP08553 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefmP08553 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NefmP08553 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefmP08553 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefmP08553 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NefmP08553 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefmP08553 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefmP08553 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefmP08553 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefmP08553 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefmP08553 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NefmP08553 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefmP08553 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefmP08553 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefmP08553 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NefmP08553 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NefmP08553 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefmP08553 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefmP08553 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms