Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04212 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04212 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04212 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04212 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04212 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04212 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P04212 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04212 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04212 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P04212 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04212 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04212 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms