Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01727 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01727 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01727 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01727 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01727 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01727 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms