Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01672 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01672 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01672 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01672 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01672 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01672 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01672 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms