Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01643 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01643 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01643 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01643 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01643 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01643 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01643 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01643 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01643 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01643 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01643 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01643 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01643 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01643 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms