Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtatp6P00848 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms