Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3fO88632 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3fO88632 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms