Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnmt3bO88509 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnmt3bO88509 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms