Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cfdp1O88271 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfdp1O88271 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms