Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10509O88255 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms