Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd46O88174 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cd46O88174 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd46O88174 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms