Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChkbO55229 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChkbO55229 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChkbO55229 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChkbO55229 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms