Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copb2O55029 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copb2O55029 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Copb2O55029 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Copb2O55029 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Copb2O55029 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms