Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxd2O35392 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd2O35392 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms