Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd9O35177 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Nedd9O35177 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd9O35177 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Nedd9O35177 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd9O35177 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd9O35177 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Nedd9O35177 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Nedd9O35177 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd9O35177 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd9O35177 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nedd9O35177 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nedd9O35177 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nedd9O35177 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Nedd9O35177 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nedd9O35177 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms