Protein–RNA interactions for Protein: O08934

Uncx, Homeobox protein unc-4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UncxO08934 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UncxO08934 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UncxO08934 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UncxO08934 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UncxO08934 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UncxO08934 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UncxO08934 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UncxO08934 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UncxO08934 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UncxO08934 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UncxO08934 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UncxO08934 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UncxO08934 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UncxO08934 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UncxO08934 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UncxO08934 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UncxO08934 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UncxO08934 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UncxO08934 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UncxO08934 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UncxO08934 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UncxO08934 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UncxO08934 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UncxO08934 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UncxO08934 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UncxO08934 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UncxO08934 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UncxO08934 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UncxO08934 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UncxO08934 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UncxO08934 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UncxO08934 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UncxO08934 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms