Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730507C01RikJ3QPX0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms