Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spin2fJ3QPU0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spin2fJ3QPU0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spin2fJ3QPU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spin2fJ3QPU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spin2fJ3QPU0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spin2fJ3QPU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms