Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XntrpcF8VQM8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XntrpcF8VQM8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms