Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Farp1F8VPU2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Farp1F8VPU2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms